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期刊论文
1. 吴振汉，1982，〈明代奴仆的生活概况〉，《史原》，第12期，页27-64。2. 吴振汉，1982，〈明代的主仆关系〉，《食货月刊》，第12卷4、5期，页27-43。
3. 吴振汉，1984，〈评介森正夫着《奴变、抗租》〉，《史原》，第13期，页237-240。
4. 吴振汉，1998，〈台湾现代工业发展初期政商间的仲介人物1950-1960〉，《国立中央大学人文学报》，第16期，页91-121。
5. 吴振汉，1999，〈王世贞《史乘考误》所论嘉隆之际史事考释〉，《国立中央大学人文学报》，第17期，页65-92。
6. 吴振汉，1999，〈王守仁抚赣时期的文人领军〉，《国立中央大学人文学报》，第19期，页35-67。
7. 吴振汉，2000，〈明代前期内阁与吏部主导人事之变迁〉，《国立中央大学人文学报》，第22期，页71-95。
8. 吴振汉，2001，〈吴宓与毛彦文─钜变时代下的两性关系〉，《国立中央大学人文学报》，第23期，页235-267。
9. 吴振汉，2002，〈明代中叶私修国史之探析〉，《史汇》，第6期，页1-21。
10. 吴振汉，2003，〈宋端仪《立斋閒录》研析〉，《国立中央大学人文学报》，第27期，页1-23。
11. 吴振汉，2003，〈明代邸报的政治功能与史料价值〉，《国立中央大学人文学报》，第28期，页1-31。
12. 吴振汉，2004，〈一则明末邸报新闻小考〉，《史汇》，第 8 期，页1-4。
13. 吴振汉，2004，〈明代赃罚探析〉，《明代研究》，第7期，页1-28。
14. 吴振汉，2006，〈明代塘报的军事功能与史料价值〉，《人文学报》，第30期，页209-238。
15. 吴振汉，2008，〈明代非殉节型自杀行为探究〉，《两岸发展史研究》，第5期，页1-36。
16. 吴振汉，2008，〈高攀龙与王国维之死比较分析〉，《史汇》，第12期，页1-7。
17. 吴振汉，2009，〈明儒高攀龙的思想与殉节〉，《国立中央大学人文学报》，第37期，页29-67
18.吴振汉，2009，〈明末山人之社会网络和游历活动－以何白为个例之研究〉，《汉学研究》，第27卷第3期，页159-190。
19. 吴振汉，2009，〈明儒高攀龙的思想与殉节〉，《中央大学人文学报》，，第三十七卷第三期，页29-67。
20. 吴振汉，2010，〈嘉靖朝锦衣卫首长之职权与活动－以陆炳（1510-1560）为例〉，《中央大学人文学报》，第四十二期，页45-81。
21. 吴振汉，2010，〈从日记到野史－文震孟、文秉父子的史事传承〉，《史汇》，第十四期，页1-5。
22. 吴振汉，2012，〈明儒李邦华的治世与殉国〉，《辅仁大学历史学报》，第二十八期，页71-102。
23. 吴振汉，2013，〈黄宗羲的南明史学〉，《中央大学人文学报》，第56期，页29-61。
24. 吴振汉，2015，〈晚明史家的竞合关系—以徐学谟、王世贞为例〉，《史汇》，第十八期，页1-30。
25.吴振汉，2019，〈水利、祭祀、豪强三者之联动关系-以大溪南兴与八德霄里为中心〉，《经纬桃园》，桃园市政府文化局，页101~134