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研究计画
1. 吴振汉，「大二历史改进教学计画」，2006.6-2007.7，609,000元，中央大学发展国际一流大学之共同科教学子计画。2. 吴振汉教授，「大二历史改进教学计画」，2007.1-7，909,094元，中央大学发展国际一流大学之共同科教学子计画。
3. 吴振汉教授，「中国近世文人殉节思想之研究」，2007.7-12，180,000元，中央研究院近代史研究所国内学人短期访问研究奖励。
4.吴振汉，「两岸发展史研究中心总计画」，2008.1-12，280,000元，中央大学发展国际一流大学及顶尖研究中心计画。
5.吴振汉，「两岸发展史研究中心—两岸发展史研究期刊」，2009.1-12，413,000元，中央大学发展国际一流大学及顶尖研究中心计画。
6.吴振汉，「世变下的中国知识分子与文化－遗民史家文秉之研究」，2011年4月1日-101年3月31日，445,000元，中央大学迈向顶尖大学计划。
7.吴振汉，「世变下的中国知识分子与文化-清初遗民与遗臣的私修明史学-黄宗羲的南明史学」，2012年4月1日-101年3月31日，445,000元，中央大学迈向顶尖大学计划。
8. 吴振汉，「世变下的中国知识分子与文化—清初遗民与遗臣的私修明史学—黄宗羲的南明史学」，(分项计画四)，2012.4.1-2012.12.31，220,000元，国立中央大学迈向顶尖大学计画。
9. 吴振汉，「世变下的中国知识分子与文化—夏允彝的师友与史学」，(分项计画三)，2013.1.1-2013.12.31，88,377元，国立中央大学迈向顶尖大学计画。