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專書及專書論文
1. 吳振漢，1992，《國民政府時期的地方派系》，台北：文史哲出版社。2. 吳振漢、周樑楷、胡昌智編著，1995，《史學導論》，台北：空中大學。
3. 吳振漢、段昌國、林滿紅、蔡相輝編著，1997，《現代化與近代中國的變遷》，台北：空中大學。
4. 吳振漢主編，2004，《大溪鎮志》，桃園：大溪鎮公所。
5. 吳振漢主編，2005，《大溪鎮志》，桃園：大溪鎮公所。
6. 吳振漢，2007，〈明儒胡直學行述評〉，《近代中國的社會學文化(960-1800)論文集》，台北：國立臺灣師範大學歷史學系，頁395-422。
7. 吳振漢，2009，〈明儒鄒元標的為學與用世〉，《中華文化的傳承與創新 - 紀念牟復禮教授論文集》，頁17-49。
8. 吳振漢，2010.4，〈嘉靖朝錦衣衛首長之職權與活動－以陸炳（1510-1560）為例〉，《中央大學人文學報》，第四十二期，頁45-82。
9. 吳振漢，2010.9，〈從日記到野史－文震孟、文秉父子的史事傳承〉，《史匯》，第十四期，頁1-5。
10. 吳振漢，2013，〈清初遺民文秉之史著與史學〉，收入王次澄、齊茂吉主編《融通與新變》，臺北：華藝學術出版社，頁353-385。
11.吳振漢，2019，《明清之際的史家與明史學》，中央大學出版中心