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專書論文
1. 吳學明，1981，〈孫中山與蘇俄〉，收入張玉法主編《中國現代史論文集》，第十輯，臺北：聯經出版社，頁 85-95 。2. 吳學明，1982，〈評介費斯著「中國的纏結：從珍珠港事變到馬歇爾使華在中國的努力」〉，收入張玉法主編《中國現代史論文集》，第九輯，臺北：聯經出版社，頁405-414。
3. 吳學明，1982，〈評介詹森著「農民民族主義與共產勢力」〉，收入張玉法主編《中國現代史論文集》，第十輯，臺北：聯經出版社，頁405- 414 。
4. 吳學明，1998，〈日治時期台灣基督長老教會研究的回顧與展望〉，《台灣基督教史 ──史料研究回顧論文集》，臺北：宇宙光出版社，頁213-236。
5. 吳學明，2007，〈客家移墾篇〉，徐正光主編《客家研究概論》，臺北：南天出版社。
6. 吳學明，2008，〈當上帝遇到天公─談基督宗教在台灣早期的傳教〉，收入於賴澤涵主編，《台灣經濟、社會與文化的變遷》，臺北：威仕曼文化出版，頁179-210。
7. 吳學明，2008，〈佛教與台灣的庶民生活〉，收入於賴澤涵主編，《台灣經濟、社會與文化的變遷》，臺北：，威仕曼文化出版，頁211-237。
8. 吳學明，2008，〈姜阿新研究初探〉，收入氏主編《地域社會與地方菁英──姜阿新與北埔》，新竹：新竹縣文化局出版。
9. 吳學明，2008.11，〈北埔姜家史料與運用〉，《第二屆臺灣古文書與歷史研究學術研討會論文集》，台中：逢甲大學歷史與文物管理研究所，頁79-102。
10. 吳學明，2011年，〈臺灣齋堂個案研究──以大溪齋明寺為中心〉，《閩臺神靈與社會》，廈門：廈門大學出版社。
11. 吳學明，2012年，〈姜紹祖及其先人之禦侮事蹟〉，《什麼人物 為何重要─臺灣史上重要人物系列(二)》，臺北：國立歷史博物館。
12.吳學明，2019.1，〈清代一個務實拓墾家族的研究：以新竹姜朝鳳家族為例〉，莊英章主編《客家形成與社會運作》（新竹：交通大學出版社），頁137-190。
13.吳學明，2019.8 ，〈義民爺信仰的形成與擴散〉，謝國興主編《進香、醮、祭與社會文化變遷》（臺北市：臺灣大學出版社），頁434-478