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研討會論文
1. 吳學明，1988.11，〈五專中國近代史教學研究〉，「77 年技術與教學研討會」，私立明志工專。2. 吳學明，1995.05，〈清代一個務實拓墾家族的研究 ── 以新竹姜朝鳳家族為例〉，「台灣家族發展史研討會」，中央研究院。
3. 吳學明，1996.05，〈鄉土史料與鄉土史教學〉，「鄉土文化教育學術研討會」，國立台南師範學院。
4. 吳學明，1998.05，〈日治時期台灣基督長老教會研究的回顧與展望〉，「台灣基督教史 ── 史料研究回顧國際學術研討會」，私立中原大學。
5. 吳學明，1999.11，〈台灣基督長老教會入台初期的一個面相 ──「靠洋勢」〉，「慶祝輔仁大學創校七十週年台灣天主教二次開教一百四十年學術研討會」，私立輔仁大學。
6. 吳學明，2001.11，〈台灣基督長老教會的醫療傳教〉，「海峽兩岸教會史研究現況學術研討會」，私立中原大學。
7.吳學明，2001.12，〈鄉土史田野工作的理論與實務〉，「九十年度金門地區村史寫作與文化資產保存維護研討會」，金門縣文史工作協會。
8. 吳學明，2002.10，〈「台灣府城教會報」及其史料價值〉，「地方文獻學術研討會」，國家圖書館。
9. 吳學明，2003.6，〈台南長榮中學及其所藏之教會史料〉，「史學與文獻學學術研討會」，私立東吳大學。
10. 吳學明，2003.10，〈終戰前台南「長老教中學」的歷史觀察〉，「歷史、地理與變遷學術研討會」，國立嘉義大學。
11. 吳學明，2004.07，〈日治時期台南縣基督宗教間的合作與競爭〉，「台南縣發展史研討會」，私立長榮大學。
12.吳學明，2004.12，〈《教會史話》與當前臺灣基督教歷史研究〉，「林本源中華文教基金會2004年會暨賴永祥先生的學術世界研討會」，台北：中央研究院臺灣史研究所、林本源中華文教基金會。
13.吳學明，2005.5.7，〈終戰前的政教關係研究──以臺南長老教會中學為中心〉，「識教育與歷史專業：東亞研究的微觀與宏觀學術研討會」，私立萬能科技大學。
14. 吳學明，2005.11，〈清代台灣地方志書的客家書寫〉，「第九屆台灣歷史文化學術研討會」，私立東海大學。
15. 吳學明，2005.10.24-25，〈姜阿新研究初探〉，「北埔姜阿新故宅學術研討會」，中央大學客家社會文化研究所。
16. 吳學明、陳凱雯，2005.12.2，〈北埔姜家與台灣的禦侮戰爭〉，「乙未之役客家抗日學術研討會」，國立台灣師範大學。
17. 吳學明，2006.12.15-17，〈通識課程中的台灣史課程檢討〉，「台灣史研究相關系所之現況與展望探討」國際學術研討會，政治大學台灣史研究所。
18. 吳學明、陳雪娟，2006.12.2-3，〈南桃園的義民信仰與地方社會─以平鎮褒忠祠為例〉，「族群、歷史與文化亞洲聯合論壇：人物與地域研究國際學術研討會」，中央大學客家學院。
19. 吳學明，2007.9，〈客家產業發展〉，「2007新竹義民節慶．文化與觀光國際學術研討會」，明新科技大學。
20. 吳學明，2007.10.5-6，〈客家的地域社會與宗教活動─楊梅地區的土地開墾與義民信仰之歷史考察〉，「客家地方比較研究工作坊研討會」，國立交通大學客家學院。
21. 吳學明，2008.5.3，〈新竹北埔姜家史料與運用〉，「第二屆歷史與文獻學術研討會」，台中：私立逢甲大學歷史與文物研究所。
22. 吳學明，2009.12.12，〈三官廟信徒信仰的形成與演變：以太平地與三坑子三官廟為例〉國立交通大學客家學院主辦「四溪計畫期末論文發表會」。
23. 吳學明，2010年，〈清代北臺灣鳳山溪流域的三官大帝信仰源流小考─以新竹縣新埔鎮的大茅埔三元宮為例〉，「臺灣客家族群的聚落、歷史與社會變遷研討會」，交通大學客家文化學院。
24. 吳學明，2010年，〈臺灣義民爺信仰的擴散與演變〉，「2010臺灣客家文化發展論壇」。
25. 吳學明，2011年，〈中華民國褒忠義民廟聯誼協會研究〉，「2011年族群、歷史與文化亞洲聯合論壇：當代客家之全球發展」，中央大學客家學院。
26. 吳學明，2012.12.22，〈客庄的消失與客蹤再現〉，「2012新北市客家之回顧與前瞻論壇」，新北市客家文化園區。
27. 吳學明，2013年，〈新近桃竹苗地區古文書的收集及其史料價值〉，「第七屆臺灣古文書與歷史研究國際學術研討會」專題演講，逢甲大學歷史與文物研究所。
28. 吳學明，2013年12月，〈臺北新客家的原鄉信仰〉「2013新北市客家之回顧與前瞻論壇」，臺灣大學客家研究中心。
29. 吳學明，2016年5月13-14日〈清末北台灣的聯防組織〉，「變動中的東亞：跨域視野的觀察國際學術研討會」，桃園：國立中央大學歷史研究所主辦。
30. 吳學明，2016年10月9日，〈桃園歷史記憶書寫的構想與議題〉，「2016桃園研究論壇：歷史文化」，桃園：桃園市政府文化局。
31.吳學明，2016.12，〈桃園研究與桃園學芻議〉，《2016桃園學研討會》，國立臺灣大學客家研究中心主辦(專題演講)，頁6-13。
32.吳學明，2018.10，〈在地客家研究的議題與視角〉，《2018臺中客家文化學術研討會》，臺中市政府客家事務委員會主辦(專題演講)，頁9-17。